Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkd1Q99MH6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms