Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp1b4Q99ME6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms