Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp16Q99LG0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms