Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms