Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pagr1aQ99L02 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pagr1aQ99L02 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms