Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ciao1Q99KN2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms