Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms