Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms