Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf112Q96DY5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf112Q96DY5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf112Q96DY5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf112Q96DY5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf112Q96DY5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf112Q96DY5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf112Q96DY5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf112Q96DY5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf112Q96DY5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf112Q96DY5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf112Q96DY5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf112Q96DY5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf112Q96DY5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf112Q96DY5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf112Q96DY5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf112Q96DY5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf112Q96DY5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms