Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn16Q925N4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms