Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prss28Q924N9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms