Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf3Q922U1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf3Q922U1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms