Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpe65Q91ZQ5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms