Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Setd3Q91WC0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Setd3Q91WC0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Setd3Q91WC0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Setd3Q91WC0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Setd3Q91WC0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Setd3Q91WC0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Setd3Q91WC0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Setd3Q91WC0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Setd3Q91WC0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Setd3Q91WC0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Setd3Q91WC0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Setd3Q91WC0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Setd3Q91WC0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Setd3Q91WC0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Setd3Q91WC0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Setd3Q91WC0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Setd3Q91WC0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Setd3Q91WC0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Setd3Q91WC0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Setd3Q91WC0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Setd3Q91WC0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Setd3Q91WC0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Setd3Q91WC0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Setd3Q91WC0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Setd3Q91WC0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Setd3Q91WC0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Setd3Q91WC0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Setd3Q91WC0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Setd3Q91WC0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms