Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA3

Hdac11, Histone deacetylase 11, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac11Q91WA3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdac11Q91WA3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms