Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usb1Q91W78 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms