Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NifkQ91VE6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NifkQ91VE6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms