Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms