Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cabp4Q8VHC5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cabp4Q8VHC5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms