Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc115Q8VE99 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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