Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Slc6a20aQ8VDB9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Slc6a20aQ8VDB9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Slc6a20aQ8VDB9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Slc6a20aQ8VDB9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Slc6a20aQ8VDB9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Slc6a20aQ8VDB9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Slc6a20aQ8VDB9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Slc6a20aQ8VDB9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Slc6a20aQ8VDB9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Slc6a20aQ8VDB9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Slc6a20aQ8VDB9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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