Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW8

Ttc36, Tetratricopeptide repeat protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc36Q8VBW8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc36Q8VBW8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms