Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ccdc58Q8R3Q6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ccdc58Q8R3Q6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ccdc58Q8R3Q6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ccdc58Q8R3Q6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccdc58Q8R3Q6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccdc58Q8R3Q6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccdc58Q8R3Q6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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