Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3C1

Uncharacterized protein C2orf42 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R3C1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R3C1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8R3C1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R3C1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R3C1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R3C1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R3C1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8R3C1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8R3C1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms