Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2N2

Utp4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp4Q8R2N2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp4Q8R2N2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp4Q8R2N2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms