Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

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Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Impg1Q8R1W8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Impg1Q8R1W8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Impg1Q8R1W8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Impg1Q8R1W8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Impg1Q8R1W8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms