Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg10Q8R1P4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms