Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1M2

H2afj, Histone H2A.J, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afjQ8R1M2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afjQ8R1M2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afjQ8R1M2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afjQ8R1M2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afjQ8R1M2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afjQ8R1M2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afjQ8R1M2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2afjQ8R1M2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afjQ8R1M2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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