Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z2

Fndc5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc5Q8K4Z2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc5Q8K4Z2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.7 ms