Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms