Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28aQ8K3Y3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms