Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrrdQ8K2M3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrrdQ8K2M3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms