Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Abcf3Q8K268 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Abcf3Q8K268 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Abcf3Q8K268 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Abcf3Q8K268 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcf3Q8K268 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Abcf3Q8K268 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Abcf3Q8K268 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Abcf3Q8K268 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Abcf3Q8K268 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Abcf3Q8K268 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Abcf3Q8K268 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Abcf3Q8K268 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcf3Q8K268 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Abcf3Q8K268 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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