Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms