Protein–RNA interactions for Protein: Q8K129

Ctxn1, Cortexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1Q8K129 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctxn1Q8K129 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms