Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CopaQ8CIE6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms