Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NgefQ8CHT1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NgefQ8CHT1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NgefQ8CHT1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms