Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms