Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms