Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms