Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms