Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDS7

Uncharacterized protein C21orf140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CDS7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CDS7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8CDS7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CDS7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CDS7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CDS7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CDS7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q8CDS7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q8CDS7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CDS7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q8CDS7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CDS7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q8CDS7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CDS7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CDS7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CDS7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CDS7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CDS7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CDS7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CDS7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CDS7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CDS7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CDS7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8CDS7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CDS7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CDS7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CDS7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CDS7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CDS7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CDS7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CDS7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CDS7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CDS7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CDS7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q8CDS7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CDS7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CDS7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CDS7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CDS7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CDS7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CDS7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CDS7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CDS7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CDS7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CDS7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CDS7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8CDS7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8CDS7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8CDS7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q8CDS7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8CDS7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8CDS7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8CDS7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q8CDS7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8CDS7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8CDS7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q8CDS7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8CDS7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8CDS7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8CDS7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8CDS7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8CDS7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8CDS7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8CDS7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8CDS7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8CDS7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q8CDS7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q8CDS7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q8CDS7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8CDS7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Q8CDS7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8CDS7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8CDS7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8CDS7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8CDS7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8CDS7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8CDS7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8CDS7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8CDS7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8CDS7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8CDS7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q8CDS7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Q8CDS7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8CDS7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8CDS7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q8CDS7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms