Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc38Q8CDN8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms