Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc73Q8CDM4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms