Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc87Q8CDL9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms