Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacnb2Q8CC27 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms