Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms