Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrn3Q8CBC6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Lrrn3Q8CBC6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Lrrn3Q8CBC6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Lrrn3Q8CBC6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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