Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Fbxo48Q8CAT8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms