Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nhsl1Q8CAF4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nhsl1Q8CAF4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms